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MiSeq
®
デスクトップ型の次世代シーケンサー
使ってみたらこんなに簡単。世界に挑戦する私のパートナー。
▶ 最短 8 時間で DNA からデータ解析
▶ 世界シェア No.1 のテクノロジー
▶ 圧倒的なコストパフォーマンス
最短 8 時間で DNA からデータ解析
MiSeq システムは革新的な一体型システムデザインにより、抜群の使いやすさを誇ります。これまでの次世代シーケンサー
は DNA 増幅からシーケンス、データ解析のワークフローは別々の装置で行っていましたが、MiSeq では一連のステップの
自動化に成功しました。わずか 15 分のハンズオンでランが開始でき、データ解析まで自動で行います。 2 時間で終了する
Nextera サンプル調製キットを組み合わせれば、DNA からデータ解析まで最短 8 時間（35 塩基シングルリードの場合）で
実施できます。
各ステップごとに装置とハンズオンが必要です。
これまでの次世代
シーケンサー
ハンズ
オン
DNA 増幅
ハンズ
オン
DNA 増幅からシーケンス、データ解析が全自動
ハンズ
オン
ハンズ
オン
シーケンス
データ解析
サンプル調製
MiSeq
オプション
データ保管、解析
サンプル調製
15 分のハンズオンでラン開始
ベースコール
サンプル調製：断片化装置
不要の 2 時間反応 *
試薬カートリッジで
ランをスタート
MiSeq Reporter で
安心のデータ解析
酵 素 反 応 に よ り DNA 断 片 化 を 行 う
試薬キットはカートリッジ式になっていま
シ ス テ ム に 内 蔵 さ れ た Windows コ ン
Nextera テクノロジーでは、高額な断片化
す。調製したサンプルをアプライして準備
ピューターでは、
ベースコールとアライメン
装置を必要としません。断片化、
アダプター
は完了。フローセルと試薬カートリッジ、
トを行います。さらに MiSeq Reporter ソ
付加反応はシングルチューブで行うため、
廃液ボトルなどをセットした後は、タッチパ
フトウェアでは、ベースコール、アライメン
DNA のロスも少なくわずか 50ng の DNA
ネルでランを開始すると自動でデータ解析
ト、アプリケーションに応じた解析を行い
からスタートできます。
まで行います。
ます。
* TruSeq サンプル調製キットの場合は断片化装置が必要
トランスポソーム
ゲノムDNA
です。
～ 300bp
タグメンテーション
～ 300bp
P5
Index 1
Read 1 Sequencing Primer
Read 2 Sequencing Primer
Index 2
P7
PCR増幅
p5
Index1 Rd1 SP
Rd2 SP Index2
シーケンス解析用ライブラリー
p7
Nextera のワークフロー
MiSeq Reporter の一例
Resequencing
Small RNA
de novo Assembly
Amplicon
16S Metagenome
QC Library
世界シェア No.1 の実績とテクノロジー
これまで国内外の多くのプロジェクトで採用されてきたイルミナの
1 塩基合成反応（SBS:Sequence by Synthesis）はホモポリマー
■L社
3,865 5%
■R社
配列も高精度な読み取りが可能です。 6,000 以上の研究論文に貢
9,520 13%
献し、公的データベースにも圧倒的な登録数を誇るイルミナのテク
ノロジーから、数多くの次世代シーケンサー手法が確立されました。
グラフ：国際データベースのデスクトップ型次世代シーケンサー
データ登録数（2014 年 12 月現在 http://sra.dbcls.jp）
■ イルミナ MiSeq
61,083 82%
多彩なアプリケーションを迅速、高精度に解析
16S メタゲノム解析
96 サンプル同時ラン
20 株の大腸菌
de novo アセンブル
FFPE 癌サンプルから
KRAS 第 2 エクソンを解析
16S 超可変 V4 領域（254bp）を増幅
大腸菌 MG1665 を解析（150bp x2）
胃および直腸癌由来 FFPE サンプルか
し、96 サンプルを 1 ラン（150bp x2）
し、de novo アセンブル。コンティグ
ら、KRAS 第２エクソンを増幅して解析
で解析。イヌ、イヌの飼主（ヒト）から
最 大 長 は 311Kb、N50 は 148Kb と
（75bp x2）。直腸癌にて 27.5% の頻
のサンプルは、フリーソフトウェアパッ
良好な結果が得られました。ランあた
度で C から G へ塩基変異があること
ケージの QIIME を使用して門レベル
り 20 サンプルの解析が可能です。
がわかり、この変異は正常サンプルで
の分類が行われました。
も 1.1% で観察されました。
リファレンスコール（総数の%）
100
90
発現の比率
（16S rRNA遺伝子配列の割合）
80
70
60
50
40
30
20
10
0
イヌ
イヌの飼主（ヒト）
土壌
Crenarchaeota
Nitrospirae
Euryarchaeota
OP3
AD3
Planctomycetes
Acidobacteria
Proteobacteria
Actinobacteria
SC3
Armatimonadetes
SC4
BRC1
SM2F11
Bacteroidetes
SPAM
CCM11b
SR1
Chlamydiae
Spirochaetes
Chlorobi
Synergistetes
Chloroflexi
TM6
Cyanobacteria
TM7
Elusimicrobia
Tenericutes
Firmicutes
Thermi
Fusobacteria
Verrucomicrobia
GAL15
WPS-2
Gemmatimonadetes
WS3
Lentisphaerae
変異コール（総数の%）
100
80
60
40
変異 27.5%
20
変異 1.1%
0
NA18507
コントロール
QIIME を用いた門レベルでの分類
大腸菌アセンブルの結果を Circos で表示
一足先をゆくクラウドソリューション
クラウドサービスの BaseSpace はシーケンスデータの保管と解析アプリを
提供します。1TB まで無償で利用可能なため、
MiSeq データも約 200 ラン
分 * の保管が可能です。また、BaseSpace ではサードパーティが開発した
解析アプリを自由に組み合わせデータの解析と可視化を行え、共同研究者
とのデータ共有も安全かつ効率的に行うことができます。
* 150bp x2, PhiX サンプルのランの場合を想定しています。
直腸癌
直腸正常
3 サンプルにおける変異の割合
ブレイクスルーのパフォーマンスと価格
製品仕様
サイズ
： 幅 × 奥行き × 高さ：68.6cm × 52.3cm × 56.5cm、重量：54.5kg
所要電源
： 100V AC、50/60Hz、10A、400W
内蔵コンピューター ： Windows 7 標準、750GB ハードドライブ、16GB RAM
コンピューターの仕様は定期的に更新されます。最新の構成についてはお問い合わせください。
動作環境
： 温度 22℃ ± 3℃、湿度 20-80%（結露なきこと）
、高度 2,000m 未満、汚染度評価 2
検出
： 発光ダイオード 530nm、660nm
パフォーマンス *
MiSeq v2 試薬キット
MiSeq v3 試薬キット
リード長
リード数
データ量
36bp x1
150bp x2
250bp x2
75bp x2
300bp x2
1200 ∼ 1500 万
2400 ∼ 3000 万
2400 ∼ 3000 万
4400 ∼ 5000 万
4400 ∼ 5000 万
540 ∼ 610Mb
4.5 ∼ 5.1Gb
7.5 ∼ 8.5Gb
3.3 ∼ 3.8Gb
13.2 ∼ 15Gb
DNA 増幅からシーケンス
までの時間 **
∼ 4 時間
∼ 24 時間
∼ 39 時間
∼ 20 時間
∼ 55 時間
Q30 以上の塩基
90％以上
80％以上
70％以上
85％以上
70％以上
* イルミナ PhiX ライブラリーを使用し、サポート内のパスフィルターのクラスター密度（MiSeq v2 試薬キットの場合は 467-583k/mm2、MiSeq v3 試薬キットの場合は 727-827k/mm2）で
実施します。実際の数値はサンプルに依存することがあります。 Q30 以上の塩基の割合は、そのラン全体の平均値です。
** 調製済みライブラリーからシーケンスまでの合計時間です。
システム価格
カタログ番号
MS-J-001
SV-420-1002
製品名
希望販売価格（円）
MiSeq システム（DNA 増幅、シーケンサー、データ解析コンピューター内蔵）
MiSeq 年間保守契約 Basic
16,500,000
2,150,000
試薬消耗品価格
カタログ番号
製品名
シーケンスラン試薬キット（ランに必要なフローセル、試薬カートリッジ、ボトルを含みます）
サンプルあたり
希望販売価格（円）
毒物
約 2500 万クラスター（3.75Gb）
MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycles)
毒物
約 2500 万クラスター（15Gb）
MiSeq Reagent Kit v3 (600 Cycles)
毒物
約 1500 万クラスター（750Mb）
MiSeq Reagent Kit v2 (50 Cycles)
毒物
約 1500 万クラスター（4.5Gb）
MiSeq Reagent Kit v2 (300 Cycles)
毒物
約 1500 万クラスター（7.5Gb）
MiSeq Reagent Kit v2 (500 Cycles)
毒物
約 400 万クラスター（1.2Gb）
MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300 Cycle)
毒物
約 100 万クラスター（300Mb）
MiSeq Reagent Nano Kit v2 (300 Cycle)
毒物
約 100 万クラスター（500Mb）
MiSeq Reagent Nano Kit v2 (500 Cycle)
サンプル調製キット（その他、Small RNA、RNA-Seq、ChIP-Seq キットもご用意しています）
FC-121-1030
Nextera DNA Sample Prep Kit (24 Samples)
15,250
FC-121-1011
Nextera Index Kit (24 Indices, 96 Samples)
488
毒物
FC-131-1024
Nextera XT DNA Sample Prep Kit (24 Samples)
6,083
FC-131-1001
Nextera XT Index Kit (24 Indices, 96 Samples)
488
MS-102-3001
MS-102-3003
MS-102-2001
MS-102-2002
MS-102-2003
MS-103-1002
MS-103-1001
MS-103-1003
Nextera シリーズはそれぞれ対応する Index Kit とあわせてお使いください。
代理店
〒108-0014 東京都港区芝 5-36-7 三田ベルジュ 22 階
Tel (03) 4578-2800 Fax (03) 4578-2810
www.illuminakk.co.jp
www.facebook.com/illuminakk
本製品の使用目的は研究に限定されます。 販売条件：www.illuminakk.co.jp/tc
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llumina, IlluminaDx, BaseSpace, BeadArray, BeadXpress, cBot, CSPro, DASL, Design Studio, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer,
GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, Infinium, iSelect, MiSeq, Nextera, NextSeq, NuPCR, SeqMonitor, Solexa, TruSeq, TruSight,
VeraCode, the pumpkin orange color, the Genetic Energy streaming bases design は、Illumina, Inc. の商標または登録商標です。
その他の会社名や商品名は、各社の商標または登録商標です。予告なしに仕様および価格を変更する場合があります。
Pub. No. MiSeq カタログ 01JAN2015
366,000
46,800
146,000
46,800
価格に消費税は含まれません。
※ 2015 年 1 月 1 日現在の価格です。
毒物 このマークの製品には毒物および劇物取締法にて指定されている毒物が含まれます。
イルミナ株式会社
149,000
260,000
135,000
173,000
192,000
144,000
95,400
116,000