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RT-PCR 用プライマーの実用性確認および開発
概要
近年、植物ウイルス病の診断方法として、遺伝子診断法が多く利用されています。その中でも RT-PCR 法 1 は、非常に
高感度かつ迅速（約６時間）にウイルス病を診断することが可能です。本センターでは、既報のプライマーが実用的に使
用できるかどうかの確認を行い、さらに新たなプライマー2 を開発したので紹介します。
実用性が確認できたプライマーは、順次追加していく予定です。
1. RT-PCR 法によるウイルス診断
ウイルス RNA を利用し、植物内のウイルスの存在を判定する非常に精度の高い診断
2. プライマー
ウイルス RNA 増幅の足場となる短い DNA 断片
表. 使用可能なプライマー一覧
宿主植物
チューリップ
検出対象ウイルス
TMMMV
BYMV
FreMV
フリージア
FreSV
ASGV
CMV
ユリ
LSV
LMoV
クリスマスローズ
HeNNV
ブルグマンシア
CDV
ウメ
CNSV
プライマー名および塩基配列（5' to 3'）
ophio-CPf : GAAAGCTCAGAAAAATCAGC
ophio-CPr : CCCTGGCTTTAGATCAAGA
OP1 : GGAAGRTATTTYCATAGRGC
OP2 : TGTTRTCCACTCCWCCTGTT
BCPF : TCTGACCAAGAACAACTCAA
BCPD : CTAAATACGAACACCAAGCA
FMV-F : GGGATAGGATTGTACCCGAGTTG
FMV-R : TCAGCGTCAAGTTGCTCTG
ophio-CPf : GAAAGCTCAGAAAAATCAGC
ophio-CPr : CCCTGGCTTTAGATCAAGA
OP1 : GGAAGRTATTTYCATAGRGC
OP2 : TGTTRTCCACTCCWCCTGTT
CTLV-ON : ATTCAGCTCGTTTCTTGGAG
ASCT-3' : AGAGTGGACAAACTATAGAC
CTPALL5 : YASYTTTDRGGTTCAATTCC
CTPALL3 : GACTGACCATTTTAGCCG
CMVCPｆ : GCTTCTCCGCGAG
CMVCPｒ : GCCGTAAGCTGGATGGAC
LS1f : CTCTCACTTGTTACCGCAAG
LS2r : CCGCGTGTTGTATTGGAAGC
Potyvirid1 : CACGGATCCCGGG(T) 17VGC
Potyvirid2 : ACCACAGGATCCGGBAAYAAYAGYGGDCARCC
HeNNV 7226F : ATGCCGACTGAACAGGAAAT
HeNNV 8138R : TTAGTCGCTCTCAGAACCG
CDV-CP-131F : GTTCTAGTGGAACCTTTAGTGTA
CDV-CP-344R : ATCTGTTCATCAGTAACTTCATAA
RNA1 RdRp F : GAATGTTACTATTACTGATGGTAGT
RNA1 RdRp R : ACATTTAGAGCTAATTCATAGAG
本センターで開発を行ったプライマー
TMMMV：Tulip mild mottle mosaic virus， BYMV：Bean yellow mosaic virus，
FreMV：Freesia mosaic virus， FreSV：Freesia sneak virus，
ASGV：Apple stem grooving virus， CMV：Cucumber mosaic virus，
LSV：Lily symptomless virus， LMoV：Lily mottle virus，
HeNNV：Helleborus net necrosis virus， CDV：Colombian datura virus，
CNSV：Cycas necrotic stunt virus
＜お問い合わせ＞
本診断についてのお問い合わせはこちらから。
URL：https://cpscent.ws.hosei.ac.jp/wp/contact_form
引用または設計者*
長尾ら（2012） *
Vaira et al ，（2003）
Kumar et al ，（2009）
水田ら（2013） *
長尾ら（2012） *
Vaira et al ，（2003）
吉川ら，（1996）
Choi et al ，（1999）
Nemat et al ，（2006）
佐藤ら，（2003）
Gibbs & Mackenzie，
（1997）
長尾ら（2011） *
諸橋ら（2014） *
丸山ら（2014） *