Clinical-seq パイプライン販売開始! NGS データ解析サーバ キャンペーン 2015年3月末までの発注限定 次世代シーケンス(NGS;Next-Generation Sequencing)のデータ解析環境にご満足されていますか? Clinical-seqパイプラインは、 シーケンスデータからSNV / Indelを検出し、最新のアノテーション情報を用いて、 使用目的に合った報告書を作成するパイプラインです。 システムは完全に自動化されているため、解析結果の 検討作業にかかっていた手間と時間を軽減し、注目している変異をスピーディに抽出します。 3種のファイルを指定して解析を実行! 1高精度の SNV / Indel 検出 1000 Genomes project や UK10K などの国際プロジェクトで実績のある ソフトウェアを組み合わせたパイプラインで本格的な解析 2腫瘍特異的変異検出 Target Region 正常と腫瘍で共通する変異は除外 腫瘍のみのサンプルにも対応 3充実のアノテーション 最新の公開データベースを統合した UniDB(Universal Database)付属 Samples Genes 150 万円 ( 税別 ) ∼ クリニカルレポート (.xls) を出力 報告書フォーマット決定までの流れ ○ 30種以上のアノテーションデータ一覧をお渡しします ・Disease curation ・Computational prediction ・Variant database ※データベースの追加もご相談ください。 ○ 腫瘍特異的変異の3つの分類方法をご指定ください ○ テストデータによるチューニングを行います ○ 掲載する情報、列名、列順をカスタマイズします 製品一覧 生物種や解析パイプラインに合わせた3種のモデルをそろえました。非常に静かなので、デスクの足元に置くことの できる解析環境として人気の製品です。Exome-seq、Target-seq、RNA-seq、ChIP-seqなどの解析パイプラインに 対応しています。 カスタマイズも可能です。 モデル スタンダード エンタープライズ 下記から 1 つご選択ください 解析パイプライン リファレンスゲノム ハイエンド 下記から最大 2 つご選択ください Resequence 解析パイプライン (Whole Exome / Whole Genome Sequence 対応 ) RNA-seq 解析パイプライン ChIP-seq 解析パイプライン 下記から 2 つご選択ください 下記から最大 3 つご選択ください hg19 / GRCm39(mm10)/ rn4 / rn5 / TAIR10 / MEDAKA1 CPU Intel Core i7-4770K [3.5GHz/4Core] Intel Core i7-4930K [3.4GHz/6Core] Xeon E5-2667v2 [3.3GHz/8Core] × 2 基 メモリ 32GB (8GB×4 本 ) 64GB (8GB×8 本 ) 256GB (16GB×16 本 )ECC 付 SSD:80GB(OS 用 ) HDD:2TB×1 台 ( データ用 ) SSD:120GB(OS 用 ) HDD:2TB×4 台 (RAID 構成、データ用 ) SSD:160GB(OS 用 ) HDD:3TB×8 台 (RAID 構成、データ用 ) ストレージ 筐体サイズ W220mm×H465mm×D505mm UPS なし OS W220mm×H465mm×D505mm W178mm x H437mm x D648mm あり あり CentOS 6.4 64bit (日本語版) 設置・導入 設置サービス 初回導入チュートリアル(デモデータ利用) 23 インチディスプレイ / キーボード / マウス / 本体マニュアル / クイックスタートマニュアル / インストールメディア 同梱物 納期 約 4 週間 約 4 週間 約 8 週間 対象 微生物などゲノムサイズの 小さい生物種の解析に ヒトやマウスなどの Exome/ RNA-seq/ChIP-seq 解析に 全ゲノム解析や 大量サンプルの解析に ★昨今の円安の影響でサーバ価格が上昇していますので、4 月 1 日より価格改定を行う予定です。 価格 950,000 円 ( 税別 ) 1,500,000 円 ( 税別 ) 4,200,000 円 ( 税別 ) ※3 月末ご発注分までの価格となります。 オプション (有償) サービス 内容 データ解析サポート(1年間) バイオインフォマティクス トレーニング 解析パイプラインとサーバの基本操作について、電話またはメールでの技術サポートを行います。 オンサイトによる各種トレーニングプログラムがございます。 (科目:Linux 入門、Perl 入門、R 入門、Reseq 解析、RNA-seq 解析、がん体細胞変異解析など) 詳細はチラシまたは HP をご覧ください。 パイプラインの開発 チュートリアル(実データ利用) 既存ソフトウェアでは対応していない解析について、お客様のご要望に応じたパイプラインを 開発します。 発注時にお手元のデータをお預かりし、納品時に解析結果を用いたチュートリアルを実施します。 ( 最大 3 サンプルまで ) 2015.02 アメリエフ株式会社 〒101-0047 東京都千代田区内神田 1-12-12 美土代ビル 2 階 Tel (03)5577-6408 Fax (03)5577-6407 http://amelieff.jp
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