【Clinical-seqパイプライン販売開始!】 NGSデータ解析サーバ

Clinical-seq パイプライン販売開始!
NGS データ解析サーバ
キャンペーン
2015年3月末までの発注限定
次世代シーケンス(NGS;Next-Generation Sequencing)のデータ解析環境にご満足されていますか?
Clinical-seqパイプラインは、
シーケンスデータからSNV / Indelを検出し、最新のアノテーション情報を用いて、
使用目的に合った報告書を作成するパイプラインです。
システムは完全に自動化されているため、解析結果の
検討作業にかかっていた手間と時間を軽減し、注目している変異をスピーディに抽出します。
3種のファイルを指定して解析を実行!
1高精度の SNV / Indel 検出
1000 Genomes project や UK10K などの国際プロジェクトで実績のある
ソフトウェアを組み合わせたパイプラインで本格的な解析
2腫瘍特異的変異検出
Target Region
正常と腫瘍で共通する変異は除外
腫瘍のみのサンプルにも対応
3充実のアノテーション
最新の公開データベースを統合した
UniDB(Universal Database)付属
Samples
Genes
150 万円 ( 税別 ) ∼
クリニカルレポート
(.xls)
を出力
報告書フォーマット決定までの流れ
○ 30種以上のアノテーションデータ一覧をお渡しします
・Disease curation
・Computational prediction
・Variant database
※データベースの追加もご相談ください。
○ 腫瘍特異的変異の3つの分類方法をご指定ください
○ テストデータによるチューニングを行います
○ 掲載する情報、列名、列順をカスタマイズします
製品一覧
生物種や解析パイプラインに合わせた3種のモデルをそろえました。非常に静かなので、デスクの足元に置くことの
できる解析環境として人気の製品です。Exome-seq、Target-seq、RNA-seq、ChIP-seqなどの解析パイプラインに
対応しています。
カスタマイズも可能です。
モデル
スタンダード
エンタープライズ
下記から 1 つご選択ください
解析パイプライン
リファレンスゲノム
ハイエンド
下記から最大 2 つご選択ください
Resequence 解析パイプライン (Whole Exome / Whole Genome Sequence 対応 )
RNA-seq 解析パイプライン
ChIP-seq 解析パイプライン
下記から 2 つご選択ください
下記から最大 3 つご選択ください
hg19 / GRCm39(mm10)/ rn4 / rn5 / TAIR10 / MEDAKA1
CPU
Intel Core i7-4770K
[3.5GHz/4Core]
Intel Core i7-4930K
[3.4GHz/6Core]
Xeon E5-2667v2
[3.3GHz/8Core] × 2 基
メモリ
32GB (8GB×4 本 )
64GB (8GB×8 本 )
256GB (16GB×16 本 )ECC 付
SSD:80GB(OS 用 )
HDD:2TB×1 台
( データ用 )
SSD:120GB(OS 用 )
HDD:2TB×4 台
(RAID 構成、データ用 )
SSD:160GB(OS 用 )
HDD:3TB×8 台
(RAID 構成、データ用 )
ストレージ
筐体サイズ
W220mm×H465mm×D505mm
UPS
なし
OS
W220mm×H465mm×D505mm
W178mm x H437mm x D648mm
あり
あり
CentOS 6.4 64bit (日本語版)
設置・導入
設置サービス
初回導入チュートリアル(デモデータ利用)
23 インチディスプレイ / キーボード / マウス / 本体マニュアル / クイックスタートマニュアル /
インストールメディア
同梱物
納期
約 4 週間
約 4 週間
約 8 週間
対象
微生物などゲノムサイズの
小さい生物種の解析に
ヒトやマウスなどの Exome/
RNA-seq/ChIP-seq 解析に
全ゲノム解析や
大量サンプルの解析に
★昨今の円安の影響でサーバ価格が上昇していますので、4 月 1 日より価格改定を行う予定です。
価格
950,000 円 ( 税別 )
1,500,000 円 ( 税別 )
4,200,000 円 ( 税別 )
※3 月末ご発注分までの価格となります。
オプション
(有償)
サービス
内容
データ解析サポート(1年間)
バイオインフォマティクス
トレーニング
解析パイプラインとサーバの基本操作について、電話またはメールでの技術サポートを行います。
オンサイトによる各種トレーニングプログラムがございます。
(科目:Linux 入門、Perl 入門、R 入門、Reseq 解析、RNA-seq 解析、がん体細胞変異解析など)
詳細はチラシまたは HP をご覧ください。
パイプラインの開発
チュートリアル(実データ利用)
既存ソフトウェアでは対応していない解析について、お客様のご要望に応じたパイプラインを
開発します。
発注時にお手元のデータをお預かりし、納品時に解析結果を用いたチュートリアルを実施します。
( 最大 3 サンプルまで )
2015.02
アメリエフ株式会社
〒101-0047
東京都千代田区内神田 1-12-12 美土代ビル 2 階
Tel (03)5577-6408 Fax (03)5577-6407
http://amelieff.jp