1. No category

共同利用・共同研究
施設だより
高性能分子シミュレータの演算サーバ更新（2014 年 12 月）
計算科学研究センター長 斉藤 真司
2013 年 3 月 か ら 運 用 を 開 始 し た 高
ア）、富士通製 PRIMEHPC FX10（20
このような計算資源の強化と並行し、
性能分子シミュレータ（通称、汎用コ
TFlops、1536 コア）
、SGI 製 UV 2000
計算センターではシステムの省エネル
ン）の演算サーバ部を 2014 年 12 月に
（20 TFlops、1024 コア）が利用可能で
ギー化にも努めている。2014 年 3 月か
更新し、運用を開始した。今回導入し
ある。UV 2000 は 1 つのジョブで最大
らカーテンの設置により（図 2）計算機
た シ ス テ ム は、 富 士 通 製 PRIMERGY
で 512 コア、4 TB の大規模メモリーが
室の空気の流れをコントロールし、さ
CX 2550（260 ノード、7280 コア）で
利用であり、FX10 は「京コンピュータ」
らに 2014 年 8 月からは室外機に水を噴
ある。この更新により、CPU が Sandy
のためのチューニング・テスト計算機
射することにより（図 3、図 4）、空調設
Bridge 系から Haswell 系になり 1 ノー
として使うことができる。RX 300 S7
備の冷却効率の改善を図ってきた。そ
ドのコア数が 16 個から 28 個となった
および今回導入した CX 2550 はいわゆ
の結果、昨年度よりも 1 割程度の電力
る PC クラスターと呼ばれるものである。
削減を達成している。さらに、古く消
ノードあたりのメインメモリーは同じ
CX2550 は１つのジョブに使えるコア
費電力の大きなスパコン用空調設備を
なので、コアあたりのメインメモリー
数の点で RX 300 S7 と UV2000 の中間
この 3 月に更新する予定である。消費
の容量は 8 GB から 4.5 GB 程度に縮小
に位置するものと捉えることができる。
電力の削減は地球人として対応すべき
した）。
今回の更新により、汎用コンの総演算
課題であり、まわりまわって計算機資
計算科学研究センターには汎用コン
性能が 136 TFlops から 302 TFlops に
源の増強にも繋がるものである。計算
以外に 2012 年 2 月に更新した超高速分
増強され、スパコンと汎用コンを合わ
科学研究センターでは、今後も様々な
子シミュレータ（通称、スパコン）が
せると、総合性能として約 470TFlops
工夫・努力を通して、分子科学を中心
ある。こちらは引き続き運用されてお
のシステムとなった。各ユーザーの研
とする研究分野に大規模計算環境を提
り、富士通製 PRIMERGY RX300 S7
究課題に合わせ、これらの演算サーバ
供していきます。
（130 TFlops、350 ノ ー ド、5472 コ
を有効に使っていただければ幸いです。
（ノードあたりのコア数は増大したが
図 1 新しく導入された PRIMERGY CX2550
図 3 水噴射設備
42
分子研レターズ 71 March 2015
図 2 計算科学研究センター旧棟のスパコンに
設置されたカーテン。
図 4 室外機のサーモグラフィ写真。水の噴霧により室外機の温度が
約 15 度低下していることが分かる。