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アジレント・テクノロジー
次世代シーケンサー用ソリューション
SureSelect
Coding + プロモーター + エンハンサー
113.7 Mb の領域をキャプチャ
V5 + Regulatory
次 世 代 シー ケン サ によるエクソーム 解 析 の 世 界 標 準、アジレント・テ クノロジー の
SureSelect All Exon V5 の Coding 領域にプラスして、Regulatory 領域を同時にキャプチャ
するデザインです。プロモーターや一 部のエンハンサー領域を、Coding 領域とともに
Deep シーケンスすることにより、疾患研究に新しい知見をもたらす可能性があります。
また RNA-Seq や ChIP-Seq と組み合わせることで、制御領域の変異が遺伝子発現に与え
る影 響をより詳 細に調べることができます。Coding 領域をキャプチャするプローブと、
Regulatory 領域をキャプチャするプローブのブレンド比を最適化し、より均一なカバレッジ
を達成しています。
特 長
●
定評あるエクソンシーケンスの V5 のターゲット領域に加えて、
プロモーターと一部のエンハンサー領域をキャプチャするデザイン。
ターゲット領域のサイズは、113.7 Mb
●
イルミナシーケンサ、ライフテクノロジーズ Ion Proton 対応
●
必要なゲノム DNA 量は 50 ng ∼ 3 µg
Regulatory 領域の Deep シーケンスが可能に！
Total Target Size：113.7 Mb
Selected Regulatory Regions
Coding Regions
Human All Exon V5
Target
Size
50 Mb
# Genes
21,522
# Targeted
Exons
357,999
• Promoter TSS~1 kb（17.1 Mb）
• Selected Enhancer（40.8 Mb）
• RegulomeDB Variants Category1
デザイン監修：
（5.8 Mb）
東京大学大学院新領域創成科学研究科
鈴木 穣先生
イルミナ HiSeq2500を用いて、1レーン
さらに本データを Coding 領域の 50 Mb と、追加された Regulatory 領域の 63.7
4 検体で癌セルラインサンプルをラン
した例です。113.7 Mb の全ターゲッ
トの98%以上が5 x、94%前後が10 x、
80% 前後が 20 x でカバーされてい
Mb に分けて解析した例です。Coding 領域についてはターゲットの 90% 以上
が 20 x と高いカバレッジを示しています。Regulatory 領域についても、94%
以上が 10 x、80% 前後が 20 x でカバーされています。
ます。
図1
全ターゲット領域（113.7 Mb）のカバレッジ
図2
Coding 領域（50 Mb）のカバレッジ
図3
Regulatory 領域（63.7 Mb）のカバレッジ
型番
プロトコル
品名
931071
マニュアル用
SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 16 反応
931072
マニュアル用
SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応
931073
自動化用
SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応
キット以外に必要になるものについては以下のウェブページの " サポート " の項をご参照ください。
http://AgilentGenomics.jp
販売店
[ お問い合わせ窓口 ]
アジレント・テクノロジー株式会社
本社 / 〒 192-8510 東京都八王子市高倉町 9-1
●カストマコンタクトセンタ
0120-477-111
mail：email_ [email protected]
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© Agilent Technologies, Inc. 2014
Printed in Japan. Jul. 01. 2014