タンパク質、パスウェイのキュレーションデータベース Partner logo BIOBASE Knowledge Library (BKL) BIOBASE Knowledge Library (BKL)は、タンパク質情報、パスウェイ情報、および転写因子情報を収 載した統合データベースです。すべてのデータは各領域の専門家のマニュアルキュレーションによって取得されて おり、信頼性の高い最新情報がご利用いただけます。また、各種ツールによって、これらの膨大な情報を最大 限に活用することが可能です。 高品質なキュレーションデータ PhDを持つ専門分野のエキスパートが、各種文献を読み、各配列に対して機能、発現、疾患等のアノテーションを整 理し集約した情報が網羅的に収載されています。また、BKLで検索を行うと、膨大なキュレーションデータが分類・整理 された使いやすいレポートの形で表示されます。タンパク質の情報を一行に要約したタイトルラインをはじめとして、付加 価値の高いデータをご利用頂けます。 タイトルライン シノニム アノテーション 主な特徴 ・タイトルラインにはタンパク質の特徴が簡潔にまとめられ、機能予測情報も記載されています。 ・データは専門分野のエキスパートによって隔週更新され、高品質な最新情報をご利用いただけます。 ・文献情報がない配列に対してはBIOBASE社が機能予測しアノテーションを追加しています。 Copyright© 2014 CTC Life Science Corporation All Rights Reserved. 網羅的なパスウェイデータベース パスウェイ情報を網羅的に収載しています。シグナル伝達パスウェイに加えて、代謝パスウェイにも対応しています。手書きのパスウェイマップの他に、パ スウェイの編集が可能なツールもご利用いただけます。 主な特徴 • エキスパートによる最新の情報を登録 • 相互作用の情報をsemanticレベルから 詳細なレベルまで目的に合わせ情報を 確認することが可能 • 様々な相互作用の情報をまとめ、ひとつ のパスウェイを手書きのマップとして登録 • 遺伝子のオーソログ情報を記載している 為、他の生物種からの既存の情報で ネットワークを広げることが可能 ※トピック別に作成された手書きのパスウェイを参照したり(上)、パスウェ イの表示・編集ができます(下) 多様な検索方法 統合データベースの膨大な情報を最大限活用するた めの検索ツールが用意されています。 検索方法 ① Quick Search ※直観的にご利用いただけるインターフェースで検索が行えます。 ② Ontology Search タンパク質の特徴を示す用語を用いたドリル検索 (発現している場所、量、実験方法などによって 条件検索)を実行します。 ③ Advanced Search AND, OR, NOT検索をしたり、入出力項目をカ スタマイズできます。 ④ BLAST タンパク質の配列やパターンを入力し検索を行い ます。 ※タンパク質の特徴を特定した検索が行えます。 マーケティング部 Tel:03-5712-8368 E-mail:l [email protected] Copyright© 2014 CTC Life Science Corporation All Rights Reserved.
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